લગભગ 90% ઇન્ડોનેશિયનો મુસ્લિમ છે. જોકે, ફ્લોરેસ, તિમોર અને મોલુક્કા જેવા વિસ્તારોમાં ખ્રિસ્તી સમુદાયો અસ્તિત્વ ધરાવે છે, જેમાં મોટાભાગના પ્રોટેસ્ટંટ અથવા રોમન કેથોલિક છે. શહેરોમાં, ઘણા ચાઇનીઝ ખ્રિસ્તી છે, જોકે કેટલાક બૌદ્ધ ધર્મ અથવા કન્ફ્યુશિયન ધર્મનું પાલન કરે છે. હિન્દુઓ, વસ્તીના 2% કરતા ઓછા, મુખ્યત્વે બાલી અને લોમ્બોકમાં રહે છે.
